El objetivo principal del laboratorio es:

• Analizar las concentraciónes de carbono, nitrógeno y azufre en suelo y tejido vegetal; y emisiones de gases de efecto invernadero (metano, óxido nitroso, dióxido de carbono y sulfuros).
• Análisis de biomoléculas como fitohormonas y metabolitos.
• Además el laboratorio cuenta con un área en donde se puede determinar cualquier elemento indicado en la tabla periódica en una matriz sólida.

Para lo anterior, este laboratorio esta equipado con un cromatógrafo de gases, cromatógrafo de masas, analizador elemental, fluorescencia de rayos X, liofilizadora y una microbalanza.

Finalmente, el laboratorio tiene un área donde se desarrollan análisis de: a) dendrocronología, b) dendroclimatología, c) dendroecología, y d) dendroquímica en relación al cambio climático y la captura de carbono; en plantas leñosas.